南京市的酒店业很发达，不乏国际豪华品牌和各类中低档背包旅馆。综合驴友们的关注热点，主要是按区域划分，分为四大类。
最热门的当属夫子庙秦淮河区域。在城区偏南，但离地铁站有一段路,有公交车直达火车站。到总统府和钟山景区有游2路直达。价位适中。那里是南京民俗文化集中地之一,贴近秦淮河畔，可领略“十里秦淮”繁华热闹的金粉气息。南京夫子庙青年旅舍也坐落在那里。
其次是市中心的新街口地区。最大的优势是交通便利，处于各风景区的中心地带，四周商业设施林立,价位也偏高。南京新百、中央商场、金鹰国际购物中心坐落于此。附近的珠江路电子一条街在全国也有一定知名度。如家、金一村在这里都有连锁店。
紧邻新街口的鼓楼、玄武地区也是不少游客的选择。那里同样处于闹市区，更贴近火车站，靠近玄武湖畔的可以望见湖景。轨道交通也在建设中，地段最靠近著名的湖南路美食街。这里是南京科学文化教育的中心，著名的南京大学、东南大学就位于此地区。靠近玄武湖畔的有玄武饭店、古南都明基酒店等，靠近鼓楼地区的有名人城市酒店、国瑞大酒店等。
而汤山、汤泉镇地区属于热衷于泡温泉的游客的最佳住宿地。汤山的温泉景区建设得较为发达，周边有数个景观可供游览。有汤山颐尚、南京军区疗养院、江苏省工人汤山疗养院等，但价格较贵。汤泉镇则各种档次的温泉设施都有，其中的大吉温泉度假村档次较高。
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